在西南联大博物馆里，珍藏着一面国立西南联合大学校旗。1941年，昆明市在拓东体育场举办全市运动会，联大参加了这次运动会。按照规定，正式比赛前，各单位要由旗手掌旗引导，绕场一周游行。当时联大没有校旗，经大家讨论设计了这面校旗，并由马约翰夫人在开幕前用了一夜功夫赶制绣好。这面校旗长1.45米，宽0.8米，内有一个紫色等腰三角形图案，三角形上有黑色的“国立西南联合大学”字样，象征着组成西南联大的北京大学、清华大学、南开大学三校之间精诚团结、合作办学、共克时艰。
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