神经刺激性药物暴露对伏隔核(NAc)脑区中棘投射神经元(SPNs)的细胞和分子影响已被广泛研究,在所有的NAc神经元中,中间神经元虽然只占很少比例,但其能对SPNs输出施加主导作用,包括在成瘾的情况下。然而,对NAc中间神经元可塑性的转录机制的研究目前还比较少。
表达小清蛋白(PV+)GABAergic中间神经元是局部纹状体环路中强有效的前馈抑制调节剂。在体实验表明,神经兴奋剂药物暴露后PV+中间神经元会强烈放电,并且在戒断期间其兴奋性进一步增强。同时,阻断NAc PV+中间神经元神经递质的释放就能抑制反复苯丙胺(AMPH)暴露所诱发的行为敏化和条件位置偏好。
本文中,作者使用特定细胞类型中标记细胞核分离(INTACT)的转基因小鼠模型,以纯化从PV+和SST+ NAc中间神经元,来研究AMPH暴露后NAc中间神经元染色质和基因表达的调节。
为了分离出不同的NAc中间神经元,作者利用INTACT转基因鼠(Fig.1A-C)和Pvalb-IRES-Cre 或Sst-IRES-Cre品系杂交,便可以标记和分离NAc中PV+和SST+中间神经元(Fig.1D-E),分为免疫共沉淀结和的部分(IP)和未结合的部分(UF)。
对来自单只的完整纯化的PV+或SST+细胞核进行RNA-seq,并确定与UF相比的DE基因,如图(Fig.1F-I)。最后,IP-富集基因中,中间能神经元marker明显,而UF-富集基因中,SPNs marker Ppp1r1b明显(Fig.1j,k),这也进一步证明了该分离方法的有效性。
AMPH注射35min后,纯化NAc PV+或SST+中间神经元,来识别AMPH暴露后NAc GABA能中间神经元快速PRGs(初级反应基因),首先AMPH暴露显著增加行为活性,其次nucRNA-seq发现在PV IP、SST IP和SPNs中AMPH依赖的Fos的显著上升(Fig.2A-D)。
同时在三种细胞类型中检测到相对少量的DE基因(Fig.2E-G)。也检测到常见的快速PRG TFs的诱导(Fig.2H),这说明早期反应转录因子(ERTFs)在所有的细胞类型中都被诱导。
利用RRHO分析捕获到PV+和SST+神经元之间一致的快速转录程序(Fig.2I),同时也检测到不同细胞类型之间的差异基因,如图(Fig.2J,K)。
图2:AMPH在NAc GABAergic神经元的不同群体中诱导快速PRGs的重叠程序
相对地,作者注射AMPH 3h后进行与上述相同的实验(Fig.3A-C),来识别由AMPH所调节的延迟PRGs和SRGs(二级反应基因),Bdnf作为一种延迟PRG,在UF部分中被诱导,但在GABA能中间神经元中不被诱导(Fig.3D)。
在三种不同类型的神经元中识别到大量不同的AMPH诱导的基因(Fig.3E-G),与快速PRGs程序重叠不同,延迟基因程序几乎完全不同(Fig.3H,I)。Acan编码神经周围网(PNN)蛋白Aggrecan,Aggrecan的敲除会破坏PNN并将PV+神经元转换为高可塑性状态(Fig.3J),其被AMPH选择性诱导在PV+神经元中。Cntnap4是促进PV+中间神经元突触前释放GABA的neurexin超家族成员(Fig.3M),其只被AMPK选择性诱导在PV+神经元中(Fig.3k)。
图3:AMPH给药后3小时,在不同NAc GABA能神经元群中,细胞类型特异性基因表达程序的调节
通过对INTACT纯化的神经元核使用转座酶可及性染色质测定法(ATAC-seq)来表征全基因组TF(转录因子)结合的染色质可及性。在未暴露于AMPH的小鼠中,PV+和SST+中间神经元具有独特且可复制的染色质可及性方式,能将它们彼此以及与SPNs分开(Fig.4A-C)。
作者发现,急性AMPH暴露后并未诱导PV+中间神经元或UF中染色质可及性改变(Fig.4E,F)。这种稳定性在控制快速PRG TFs产生的调控元件中也很明显,如Fos(Fig.4G)。即使在反复AMPH暴露后,PV+或UF部分的染色质可及性依然没有显著变化。
作者利用荧光激活的细胞核分选(FANS)技术从Pvalb-Cre小鼠中分Sun1-GFP标记的核,用于单核RNA测序(snRNA-seq),并通过主成分分析(PCA)进行了降维,生成了一个UMAP,该UMAP定义了具有Pvalb+核的九个簇(Fig.5A,B)。
Adarb2和Gpc5是Pvalb簇中贡献最大的差异基因,这两者在第4簇中表达最高(Fig.5C)。为了确定AMPH依赖性基因诱导是否发生在PV+神经元的特定子集中,惊讶的是,在Adarb2+子集中,除了Fos略微富集外,快速PRGs几乎没有差异(Fig.5I)。
图5:单核RNA-seq揭示了NAc中PV+中间神经元的分子异质性
NAc中细胞类型特异性染色质可及性的独特形式是否可以揭示与TFs的差异结合位点呢?暴露AMPH 3h后,在PV+、SST+和UF诱导的所有基因中识别差异染色质可及性区域,然后寻找这些区域中富含TF结合基序并匹配到TF家族中(Fig.6B-D)。在所有三种细胞类型中,确定了细胞类型特异性表达的多个TF的结合位点富集。
最后,为了确定PV+中间神经元中的哪些基因可能有助于对滥用药物的行为反应,作者评估了MeCP2 Ser421Ala KI小鼠NAc中的PV+神经元基因表达。发现,MeCP2 Ser421Ala KI小鼠的PV+神经元显示出PV特异性 ,AMPH诱导基因Cntnap4、Clstn2和Acan的表达升高(Fig.7J-K)。
总 结
在这里,作者进行了细胞类型特异性RNA和染色质测序,以鉴定AMPH在NAc中间神经元中诱导的基因调控反应。数据表明,AMPH诱导的转录变化在NAc中不同的GABA能细胞类型之间存在差异。为神经刺激性药物暴露后的神经调控提供坚实的基础。
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