将单人全基因组测序成本降至100美元,这是行业目标。2月8日,澎湃新闻记者从国产基因测序设备领域龙头深圳华大智造科技股份有限公司(下称“华大智造”,688114)方面获悉,美国当地时间2月7日,在AGBT(基因组生物学技术进展会)上,该公司发布了新款测序仪——超高通量测序仪DNBSEQ-T20×2(下称“T20”)。
据介绍,一台T20单次运行通量达42Tb(PE100,即高通量双端测序、每端各测100bp)或72Tb(PE150),是常规超高通量测序仪的4.5-7倍。以PE100为例,单次运行可产生最高42Tb的数据、相当于420例人全基因组(WGS,30×Coverage)。按照全年300个工作日计算,T20每年可完成高达5万例人全基因组测序。
综合目前公开披露信息来看,T20刷新了全球基因测序仪通量的新纪录。更为重要的是,其超强生产规模使得“超级测序工厂”成为可能,从而使得单例成本可降至100美元以下。
华大智造首席运营官蒋慧博士此前在接受澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者采访时表示,如果测序技术做到足够自动化、通量足够高、成本足够低的话,“会使得我们的产品在全球极具竞争力。”低成本也将使得该技术在更多领域扩大应用,蒋慧以农业领域为例,“测序在农业育种这块就有一些特点,比如对通量要求非常高,一旦有适用于农业育种场景下的核心工具,那就可以进一步去提升我们国家在品种选育方面的能力和水平。”
20年:测序成本30多亿美元降至100美元以下在华大智造的官网介绍中,称超级测序工厂DNBSEQ-T20×2是为满足最具挑战性的测序需求而生,旨在为世界各地的大规模基因组项目提供助力,为多组学在人类健康与疾病中的研究和应用提供工具。
在T20所构建的“超级测序工厂”中,配备了开放式的并行处理系统,可以在短时间内将测序生产规模提升至新的量级,同时支持6张超大尺寸的测序载片上机运行,每张测序载片既能独立运行不同的测序读长和测序应用,还能够支持混合测序。这也意味着其能最大程度提高测序效率和测序规模。
对其测序成本的降低,华大智造称,T20采用了创新的浸没式生化反应技术,即直接将载片浸没在试剂槽中进行生化反应,反应均匀且稳定;同时试剂槽中的测序试剂可以支持载片的多次浸泡,从而实现了将耗材成本降到极致的目标。数据测算得出,在完成5万例人全基因组测序基础上,可将单个人全基因测序成本降低至100美元以内。
华大智造称,目前,基于T20平台可展开WGS(全基因组测序)、WGBS(全基因组甲基化测序)、单细胞测序和时空组学测序等多种应用,能更好地满足基于超高通量测序的科学研究与临床研究的需求,推动基因组学、多组学和时空组学的大规模测序研究项目的展开,为基因科技的未来提供更多可能。
华大智造首席科学家Rade Drmanac博士在上述T20发布现场表示,其希望T20能够为全球基因科技的发展和普及赋能,“加速人类在基因组学领域的理解和医学应用的进展,造福人类健康。
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