JMCB丨张亮/施蕴渝、杨弋/陈显军团队阐述衰老过程中hnRNPA与TERRA共相分离调控端粒加帽过程介导端粒稳定性

JMCB丨张亮/施蕴渝、杨弋/陈显军团队阐述衰老过程中hnRNPA与TERRA共相分离调控端粒加帽过程介导端粒稳定性
2024年10月22日 16:35 生物探索

端粒是真核生物染色体末端由TTAGGG重复DNA序列和六元蛋白质复合物shelterin组成的特殊结构。它的主要功能是防止染色体末端融合,从而维持染色体和基因组的稳定。端粒末端包含一段G-rich单链区,该区域结合shelterin复合物中的POT1,再协同shelterin复合物中其它组分完成端粒末端折叠加帽,形成含有T-loop和D-loop的稳定结构。但是DNA复制完成后,与端粒末端的单链DNA亲和力更高的蛋白质RPA较POT1更易结合至端粒上,启动DNA损伤修复过程【1】。因此,POT1在DNA复制完成后优先结合端粒的单链区是端粒完成加帽过程的重要环节。有研究对POT1结合端粒过程中的DNA结合蛋白质进行了质谱分析,发现了促进端粒加帽的关键蛋白质hnRNPA1。它通过高亲和力结合端粒ssDNA,使RPA无法结合到端粒上【2】。随后,由端粒转录的长链RNA TERRA结合hnRNPA1,释放DNA的单链区。此时异源二聚体POT1-TPP1结合端粒单链DNA,再协同shelterin复合物中其它组分形成端粒稳定结构。然而,20多年来,其具体的分子机制一直不清楚。

中国科技大学张亮/施蕴渝和华东理工大学杨弋/陈显军团队合作在Journal of Molecular Cell Biology发表了最新研究成果:Phase separation of hnRNPA1 and TERRA regulates telomeric stability揭示了衰老过程中hnRNPA与TERRA共相分离调控端粒加帽过程介导端粒稳定性。

TERRA (端粒重复序列RNA) 是从端粒DNA区域转录而来的非编码RNA。TERRA在调节和维持端粒的稳定性中起着至关重要的作用。异质核核糖核蛋白 (hnRNPs) 是与复杂多样的生物过程相关的RNA结合蛋白。hnRNPA1蛋白可以识别TERRA RNA和端粒DNA。为了探究hnRNPA1与TERRA共同调节端粒加帽过程的分子机制,本研究首先通过解析蛋白质hnRNPA1 UP1结构域如何与TERRA相互作用的分子结构。通过结构分析,确定了UP1以其两个RRM结构域结合了含有两个UUAGGG重复序列的TERRA,并通过结构分析与ITC确定了相互作用表面上的关键残基。

图1. HnRNPA1 UP1结构域识别端粒RNA TERRA的分子机制(Credit: Journal of Molecular Cell Biology

研究人员还证实了全长hnRNPA1在其C端无序区域的驱动下发生相分离,并观察到TERRA促进hnRNPA1相分离。破坏UP1-TERRA对hnRNPA1液滴在体内和体外都有显著影响。结合这些数据揭示了hnRNPA1和TERRA形成液滴的分子机制以及相分离是如何参与基因组稳定性的维持的。

图2. TERRA对hnRNPA1相分离的影响(Credit: Journal of Molecular Cell Biology

该研究综合利用结构生物学,生物化学和细胞生物学的方法,分析了蛋白质hnRNPA1 UP1结构域识别端粒RNA TERRA的分子机制,探讨了TERRA对hnRNPA1相分离现象的影响,还进一步探究了hnRNPA1与TERRA在细胞中的相分离。该研究对hnRNPA1与TERRA共同调控端粒加帽过程的分子机制提出了新的见解,也为后续研究端粒稳定性提供了新的参考。

图3. TERRA与hnRNPA1调控端粒加帽过程的模式图(Credit: Journal of Molecular Cell Biology

参考文献

1. Maréchal A, Zou L. DNA Damage Sensing by the ATM and ATR Kinases. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2013 Sep 1;5(9):a012716.

2. Flynn RL, Centore RC, O'Sullivan RJ, Rai R, Tse A, Songyang Z, Chang S, Karlseder J, Zou L. TERRA and hnRNPA1 Orchestrate An RPA-to-POT1 Switch on Telomeric Single-stranded DNA. Nature. 2011 Mar 24;471(7339):532-6.

https://academic.oup.com/jmcb/advance-article/doi/10.1093/jmcb/mjae037/7769654?login=false&utm_source=advanceaccess&utm_campaign=jmcb&utm_medium=email

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