公元388年十月，前秦苻登大军将后秦姚苌团团围住，双方将士，在进行了一波惊天地泣鬼神的“哭战”之后，纷纷撤军，由进攻转为对峙模式。
苻登想到祖父苻坚死于姚苌之手，夜不能寐，夙夜兴叹。
公元389年正月，苻登毅然再次起兵，直指姚苌。前秦将士视死如生，一往无前，后秦军不能阻挡，连战皆败。
苻坚对姚苌，可以说比对慕容垂还要好，尤其是封他为龙骧将军。龙骧将军本是苻坚先祖苻洪曾经做过的官职，后来赐予了苻坚，寄予厚望！苻坚代苻生之后，“龙骧之号未曾假人”，直到姚苌的出现。苻坚此举，虽有笼络羌族势力的原因，但更是对姚苌的信任，事实上，姚苌日后病死，也正因苻坚的礼遇有加，而心生愧疚。
姚苌心中十分害怕，不禁怀疑是不是苻坚在暗中相助苻登，正所谓“平生不做亏心事，半夜不怕鬼敲门”，姚苌赶忙在军中设苻坚灵位及雕像，日日祷告。
“陛下啊，当初我的兄长姚襄北渡黄河，不过是狐死首丘，想回老家而已，可陛下您却将他在半道截杀。亡兄心中有怨，故托梦命我替他报仇，所以说杀害您，这根本不是我的本意；陛下您说说看，苻登与您，不过是要出五服的远亲，还日夜叨念报仇，臣给臣的亲哥哥报仇这事儿于情理何负！再者说了，往日您封我龙骧将军的时候怎么说的？‘卿其勉之！’这不就是叫我效法你以龙骧建功立业么！现在臣就是按照您的英明指示。陛下虽过世为神，又岂能保佑苻登来害我？难道您都忘了您赐我龙骧将军鼓励我的话了吗？现在我给你立了神像，您魂灵有归，早晚供奉不缺，请不要计较我的过错！”
这番操作。。。。。。大家也不好说什么，可是苻登恼了！他登上楼车痛骂姚苌：“自古至今，哪有弑君又为君立神像求福者？这能有用？弑君之贼姚苌速出，我要和你决一死战，以免枉害无辜之人！”
姚苌大气不敢出，高挂免战，闭营不出。
可是这又有什么用？自打立了神像，作战并没有得利，军中每夕数惊，姚苌只好赶紧把苻坚神像的头斩了下来。。。。。。
这番操作，大家懵了，“大哥，你也是一国之君，怎能这么胆小。”
公元389年三月，苻登亲率万余骑兵攻克安定（今甘肃泾川北泾河北），五月，苻登发兵进攻后秦，后秦屡战屡败。姚苌为挽回败局，遣姚崇偷袭大界，结果苻登将计就计，在安丘（今甘肃灵台境）以伏兵拦击，大败姚崇，俘获及斩首两万余人。
七月，苻登乘胜攻克平凉（今甘肃华亭西）。八月，苻登又据苟头原（今甘肃泾州西北）进逼安定，诸将劝姚苌与其决战，姚苌摇头，思量许久，说：“与穷寇竞胜，兵家之下。吾将以计取之”。留姚旻守安定，自率三万轻骑夜袭前秦辎重地，攻克大界，杀前秦毛后及南安王苻尚，擒名将数十人，驱掠男女五万余人而还。
毛皇后，年有二十有一，将门之后，英勇善战，遭袭之后，以弓箭射死甚多后秦士兵之后，被擒，死前大骂姚苌“姚苌无道，前害天子（指苻坚），今辱皇后（就是她），皇天后土，宁不鉴照！”
后亲诸将还欲乘乱而击，姚苌认为：“登众虽乱，怒气犹盛，未可轻也”。遂止。姚苌见安定地狭，且离苻登很近，便使姚硕德镇安定，迁安定千余家于阴密，遣其弟征南将军姚靖镇之。
九月，苻坚之婿，重振仇池的前秦骁将杨定攻克后秦陇城、冀城，斩姚常，捉邢奴。吓得略阳姚详立刻弃城而逃往阴密（今甘肃灵台西南）。杨定遂自称秦州牧、陇西王。前秦王苻登依杨定自称而封之，史称后仇池。（此不在十六国中）
之后，前后秦互有胜负。
公元391年十二月，姚苌于安定击退苻登，于是设置酒会，群臣眼见这几年连四分五裂的弱小前秦都打不过，自觉耻辱，连连感叹，“这事要搁在魏武王姚襄（被姚苌追谥，跟曹操相同）身上，断不会让苻登嚣张到如此地步，陛下太过胆小谨慎了。”
姚苌十分坦然，也不生气，向众将解释说：“吾不如亡兄有四，身长八尺五寸，臂垂过膝，人望而畏之，一也；当十万之众，与天下争衡，望麾而进，前无横阵，二也；温古知今，讲论道艺，驾驭英雄，收罗隽异，三也；董率大众，履险若夷，上下咸允，人尽死力，四也。所以得建立功业，策任群贤者，正望算略中一片耳”。
姚苌这话十分在理，虽然勇猛不及姚襄，但是谋略可谓首屈一指，精于算计的他，该上就上，打不过就跑，即便是缩头乌龟也无妨。正因有如此谋略，所以在与苻登的耗战中，渐渐显出了优势，毕竟关中之地，十之七八都是姚苌的，而苻登所占，多为贫苦偏远之地，这也是为什么苻登军粮不够，人肉来填的原因。
不过，姚苌想的虽好，可是人有旦夕祸福。
公元392年二月，姚苌突发重病，七月，苻登得知这个消息，厉兵秣马，摩拳擦掌，同时向苻坚神位祷告：“曾孙苻登自从受任执戈以来，将近十二年，上天赐福，皇帝降怜，所以可逢战必胜，贼军如冰雪消融般被摧垮。如今太皇帝之灵降下灾病到逆羌身上，丑虏必将不能复原。苻登当趁他毙命之机，顺行上天的诛罚，拯拔恢复皇帝的棺椁，向太庙谢罪。”
然后苻登大赦境内，起兵进逼安定。
安定于后秦意义非凡，姚苌强支病体，领兵出战。
苻登不敢含糊，设重兵列阵，然而，姚苌却派了一支偏师绕到了苻登后方。苻登惊惧，只得回撤，姚苌趁夜引军越过苻登营寨，跟踪在苻登后面。
苻登毫不知情，夜不能寐。
第二天，负责守望的士兵来报，姚苌军已不知所踪。这把苻登吓一跳：“姚羌到底是个什么人？走了我不能察，来了我不能知，大家都说他快死了，忽然又出现了，朕和这个狡羌活在同一个世上，何其不幸！”于是退还雍城（今陕西凤翔县南）。
公元393年十月，姚苌病重，回到长安。
某天，他睡梦中看见大秦天王苻坚率天官鬼兵数百人杀入宫中，前来捉他。姚苌惊惧万分，头皮发麻，不顾病体，从床上跳起，在宫中奔跑，高呼。负责保护的兵士闻言有鬼，立刻持兵器刺鬼，结果竟然误中姚苌阴部。
他睡梦中见到了苻坚率领天官使者、鬼兵数百突杀入宫中，姚苌寒毛倒竖，从床上跳起，在宫中狂呼奔走，宫中卫士听说有鬼，挥戟虚击，悲剧发生了，大戟竟然击中了姚苌的下阴！
众鬼兵哈哈大笑，纷纷高呼“正中死处。”然后拔掉兵器，姚苌一看，裆部出血石余！
这时候姚苌突然惊醒，不知是梦是真，他低头，掀开贴身内衣，惊讶的发现裆部阴肿。急忙喊来大夫，以针刺之，出血如梦！
姚苌连连高呼：“杀陛下者臣兄耳，非臣苌罪。愿不赐枉。”后三日，姚苌身死。
虽然羌人，氐人本就世仇，可是这姚苌真不要脸，在跟前秦对战期间，把苻坚的尸体还挖出来，“鞭挞无数，裸剥衣裳，荐之以棘，掘坎埋之。”当年苻坚对姚苌那是真的好啊。
姚苌死后，其子姚兴即位，苻登只当后秦无人，“姚兴小儿，我将折杖而笞之！”不曾想，姚兴才能更甚其父，于公元394年四月，将从甘泉进关中的前秦军队击败，苻登单人独骑逃亡雍州，后无家可归，收集残部进入马毛山，同时向西秦祈求援兵，得两万众。
六月，姚兴兵发马毛山，于山南击杀苻登，年五十二岁。
苻登之子苻崇逃奔湟中即位，改元延初，十月，苻崇遭西秦武元王乞伏乾归驱逐，不得已只好投奔陇西王杨定。
杨定，前仇池国国君杨国之孙，前秦将领杨安之子。后前仇池被前秦所灭，杨定被苻坚召女婿，而杨安曾随王猛消灭前燕。苻坚死后，杨定趁机逃到陇右，收集旧部，重振仇池，自称仇池公，后改称陇西王，其国后世称为后仇池国。
苻崇与杨定联合对抗西秦。不久遭西秦军击败，与杨定一同遇害，前秦政权灭亡，不过后仇池并未灭亡，他一直存在到公元442年。
至此，强大的前秦帝国消失在历史的长河中，这是十六国中第六个被灭亡的国家。
公元394年中国北方四个实力最强的国家，慕容垂的后燕，姚兴的后秦，乞伏乾归的西秦，吕光的后凉，每一个国家都似乎有着重新统一北方的能力，但是任谁也没有想到，于公元386年牛川自称代王的拓跋珪重建的代国竟然会结束百余年的五胡乱华时代，甚至重新统一北方。
