DNA多态性主要表现在三个方面，它们分别是：反映限制性酶切位点变化的限制性片段长度多态性、反映重复单位拷贝数差异的串联重复序列多态性，以及反映点突变的单核苷酸多态性。此外还有一些衍生的多态性和多态性分析，例如单链构象多态性（SSCP）、扩增片段长度多态性（AFLP）、随机扩增多态性DNA（RAPD）等。
今天咱们就先来说说限制性片段长度多态性。
1970年，Smith、Wilcox和Kelley从流感嗜血杆菌（H.influenzae）中分离到一种核酸内切酶HindⅡ，它识别并切割GTY·RAC序列（Y表示嘧啶，R表示嘌呤）。这类能通过识别特定DNA序列切割DNA的酶被统称为限制性内切酶，限制性内切酶识别的序列被称为限制性酶切位点。
DNA序列中存在着一些限制性酶切位点，用识别这些位点的限制性内切酶来消化DNA，就可以得到一组DNA片段，被称为限制性片段（restriction fragment）。
而对于一个个体而言，其DNA序列中限制性酶切位点的数目和分布是确定的，因而其限制性片段的种类和长度也是确定的，可以反映DNA分子的序列特征。
另一方面，同一物种不同个体基因组存在DNA多态性，且约10%多态性位点导致限制性酶切位点的形成或消失，因而所含限制性酶切位点的数目和分布不同，其限制性片段的种类和长度也就不同。
因此，限制性片段具有多态性，这种多态性称为限制性片段长度多态性（RFLP）。RFLP存在广泛，是一种典型的遗传标记。
1980年，Bostein建立了RFLP分析技术，即通过限制性内切酶消化联合DNA印迹法进行分析。该技术操作简单、成本低廉，从而使RFLP被选为人类基因组计划的第一代遗传标记，用于基因图谱绘制、DNA指纹分析、疾病易感性分析、基因诊断、亲权鉴定等。
