Nature期刊:揭示肿瘤环状RNA编码隐性抗原肽诱导抗肿瘤免疫

Nature期刊:揭示肿瘤环状RNA编码隐性抗原肽诱导抗肿瘤免疫
2023年12月14日 17:37 世界生命科学大会

环状RNA(circRNA),也叫环形RNA,是一类长非编码RNA,其特征在于3'和5'末端通过反向剪接形成共价连接。circRNA长期以来一直被认为是mRNA剪接过程的副产物,没有特定功能。

但近年来,人们在真菌、原生生物、植物、果蝇、小鼠以及人类细胞中发现了许多circRNA。越来越多的研究表明,circRNA并非mRNA剪接的副产物,而是在细胞中发挥重要作用的一类RNA分子。

circRNA 最早于20世纪70年代在RNA病毒中被发现。

1979 年,Hsu和Coca-Prados利用电子显微镜第一次观察到RNA可以以环状的形式存在于真核细胞的细胞质中。紧接着,Arnberg 等在酵母的线粒体中又发现了circRNA。

到了1993 年,人们在人体细胞的转录本中也发现了一些由外显子构成的circRNA。但是,在当时,circRNA仅仅被认为是一类由外显子转录本发生错误剪接而形成的低丰度RNA分子,因而对它们的研究不够深入,以至于到1999年发现的circRNA数目也只有少数几种。

但近年来,随着RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq) 技术的广泛应用和生物物理学技术的快速发展,人们发现人类许多外显子的转录本可被非线性地反向剪接或通过基因重排而形成circRNA,且它们在所有剪接转录本中占了相当大的比例。

Jeck等在人类成纤维细胞中检测出了高达25000多种的circRNA;而Memczak等通过RNA-seq 数据结合人白细胞数据库鉴定出1950种人类circRNA、1903种小鼠circRNA (其中81种与人类circRNA相同)和724种线虫circRNA。

虽然人们开展circRNA的生物学功能及其在人类疾病发生、发展中作用的研究才刚刚起步,但这方面的进展非常迅速。

2020年9月,中山大学孙逸仙纪念医院苏士成团队等,在国际顶尖学术期刊Cell发表一篇题为:Targeting Mitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output的研究论文。

这项研究确定了一种线粒体特异性circRNA——SCAR,在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)中表达下调,向线粒体特异性递送SCAR,可降低线粒体活性氧(mROS)输出,减轻炎症,可作为NASH的治疗靶标。

而最近,苏士成团队在环状RNA研究领域再获新进展,再次在顶刊发表环状RNA研究论文。

2023年12月13日,中山大学附属孙逸仙纪念医院宋尔卫院士、苏士成教授作为共同通讯作者,在国际顶尖学术期刊Nature上发表了题为:Tumour circular RNAs elicit anti-tumour immunity by encoding cryptic peptides的研究论文。

该研究发现了一种肿瘤细胞特异性环状RNA——circFAM53B,其通过非经典翻译产生的隐性抗原肽,能够有效驱动抗肿瘤免疫,这表明利用肿瘤特异性环状RNA进行疫苗接种,可能是一种针对恶性肿瘤的免疫治疗策略。

最近的新兴数据表明,以前定义的非编码基因组可能会编码结合人类白细胞抗原(HLA)隐性抗原肽,以刺激适应性免疫。然而,隐性抗原在抗肿瘤免疫中的作用意义和机制仍不清楚。

在这项研究中,研究团队通过对人类乳腺癌样本的I类HLA(HLA-I)肽组进行质谱分析,结合核糖体测序,鉴定出一种由肿瘤特异性环状RNA——circFAM53B非经典翻译的HLA-I结合隐性抗原肽。

这些隐性抗原肽以抗原特异性的方式有效地启动了初始CD4+和CD8+T细胞,并诱导了抗肿瘤免疫。

在临床上,circFAM53B及其编码肽的表达与抗原特异性CD8+T细胞的大量浸润以及乳腺癌黑色素瘤患者更好的生存相关。

在机制上,circFAM53B编码肽与HLA-I和HLA-II分子具有强结合亲和力。

在体内,向携带乳腺癌肿瘤或黑色素瘤的小鼠注射包含肿瘤特异性环状RNA circFAM53B或其编码肽的疫苗,可诱导肿瘤抗原特异性细胞毒性T细胞的增强浸润,从而有效控制肿瘤。

总的来说,这项研究结果表明,环状RNA的非经典翻译可以驱动有效的抗肿瘤免疫,这表明利用肿瘤特异性环状RNA进行疫苗接种可能是一种针对恶性肿瘤的免疫治疗策略。

而在几天前的12月5日,苏士成团队刚刚在Cell期刊发表了题为:Choroid plexus mast cells drive tumor-associated hydrocephalus的研究论文。

该研究发现了大脑脉络丛中的一个独特肥大细胞群——脉络丛肥大细胞(CPMC),进一步揭示了这些细胞在致命的脑转移并发症肿瘤相关性脑积水(TAH)中发挥着至关重要的作用,并为TAH提供了一种有吸引力的治疗方法。

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