何振亚是陕西汉阴人，出生于1913年。高小毕业后，他投笔从戎，考入了杨虎城将军举办的军官训练班，毕业后进入西北警备第二旅任职。这支部队是由地方武装改编而成的，军纪十分涣散，何振亚多次向上级建议整顿军纪，不但没有被采纳，还遭到了训斥。因此尽管他兢兢业业，但仕途却十分不顺，干了5年还只是个小排长。
1935年12月初，警备第二旅奉命开往长安，准备和红军作战。当部队走到柞水县时，4团的一个排在我党地下工作者的带领起义，加入了红军队伍。此举引起了西安绥靖公署的恐慌，急令警二旅就地整顿，抓捕可疑人员。我党一位地下工作者因此被捕，关进了监狱，何振亚立即联络了9连中一些志同道合的人进行营救。
就在准备动手的时候，消息走漏，9连连长张纯武是一个十足的顽固派，他得到消息后，打算对何振亚下手。危急时刻，何振亚等人决定提前行动，混战中将张纯武击毙。随后何振亚等人带领9连一百多人进了秦岭，准备加入红军队伍。但不巧的是，在这一带活动的红军已经转移。何振亚决定先在宁陕一带打游击，一面扩大队伍，一面寻找红军。
在之后的大半年时间内，何振亚带领这支队伍先后在汉阴、石泉、安康、镇安等地活动，先后击败了十余支地主武装和反动民团，赢得了当地百姓的拥护，许多青壮年纷纷参军，何振亚带领的这支队伍很快扩大到800多人。1936年8月，中共西北特委决定对这支武装力量进行收编，命名为“陕南抗日第一军”，何振亚出任军长。
之后何振亚带领陕南抗日第一军以秦岭山区为根据地，与红74四师紧密配合，接连攻占了石泉马池、云雾山、佛坪迷魂岭、柞水蔡家寨和汉阴涧池等地，队伍扩大到了一千多人。抗日战争全面爆发后，何振亚先后担任了八路军115师警卫营营长、687团二营营长和豫中军分区参谋长等职。日本投降后，何振亚又参加了解放战争和抗美援朝战争。新中国成立后历任东北空军司令部参谋长、沈阳军区空军副司令员和解放军空军副参谋长等职，1955年被授予少将军衔。
